Hoe om `n TXT lêer te FASTA Skakel

Kliniese studies uitgevoer word om proteïen volgorde data te ontleed en vind behandelings vir siektes. Proteïen volgorde data is sit in die FASTA (vinnig al) formaat sodat sagtewareprogramme verstaan hoe om die data volgorde verwerk. Die FASTA formaat het tot 80 karakters per volgorde data lyn en maak gebruik van die IUB / IUPAC (International Union of Biochemie / Internasionale Unie van Suiwer en Toegepaste Chemie) kode standaard. Omskakeling van `n TXT (plain text) in te dien om FASTA formaat behels redigering of by te voeg-FASTA formaat volgorde data na `n bestaande teks lêer met proteïen volgorde data lyne. Teks editor programme soos Notepad maak hierdie maklik om te doen.

Maak die proteïen volgorde teks lêer wat jy wil wysig in `n teks redigering program soos Notepad.
Wysig of voeg die beskrywing lyn na die FASTA formaat volg. Byvoorbeeld,> gi | 129295 | sp | P01013 | OVAX_CHICK GENE X proteïen (ovoalbumine-VERWANTE) is `n geldige FASTA beskrywing lyn. Hierdie lyn bied `n unieke beskrywing vir die volgorde data lyne wat volg. Die FASTA formaat vereis dat die gebruik van die groter as simbool (>) so die sagteware program kan die unieke beskrywende inligting te identifiseer en te vermy verwerking van die beskrywing as `n proteïen data volgorde lyn.
Druk die "Enter" sleutel om `n lynbreuk voeg sodra die beskrywing lyn is geredigeer.
Wysig of voeg die proteïen volgorde data lyn formaat om te voldoen aan die IUB / IUPAC standaard kodes. Die IUB / IUPAC standaard gebruik die letters van die alfabet te aanvaarbare kodes of navraag rye verteenwoordig vir aminosure of nukleïensure in die FASTA formaat. Byvoorbeeld, QIKDLLVSSSTDLDTTLVLVNAIYFKGMWKTAFNAEDTREMPFHVTKQESKPVQMMCMNNSFNVATLPAE
verteenwoordig `n reël van geldige volgorde data sedert dit begin met die letter "V" verteenwoordig glutamine, en eindig met die letter "E" wat glutamaat.
Voeg meer volgorde data lyne, wysig bestaande volgorde data lyne of voeg lyn breek na 80 karakters as wat nodig is. Voldoening aan die FASTA volgorde data lyn standaarde en lyn breek verseker dat die program volg die instruksies wat verband hou met glutamien, glutamaat en ander brief kodes. Die briewe in die IUB / IUPAC standaard is eenvoudig instruksies om die sagteware program wat FASTA geformateer data verwerk.
Klik op "File" kies "Save" en klik op die knoppie "Save". Jou TXT lêer is nou in FASTA formaat.

Deel op sosiale netwerke:

Verwante